siRNA無償設計サービス(21 mer siRNA配列設計)

siRNA無償設計サービス(21 mer siRNA配列設計)

ニッポンジーンでは、siRNA合成サービスをご利用いただけるお客様にsiRNAの配列設計を代行するサポートを提供しています。設計したsiRNA配列を合成し、お手元にお届けするサービスです。


特 長
  • 21 mer siRNA合成サービスを利用されるお客様が対象
  • 熟練スタッフが設計した候補配列を無償提供
  • 長い実績を有するsiRNA配列設計法を利用(設計法についてはこちら)
サービスの流れ
STEP1 専用申込用紙をニッポンジーンへ送付してください。
お客様からニッポンジーンへ提供いただく情報
標的遺伝子 GenbankのAccession Numberもしくは500 bp以上の塩基配列(開始codonと終止codonの位置情報)
お客様情報 お客様情報(配達先住所、代理店名など)
希望選択 ご希望の設計方法(弊社標準法、Ui-Tei法、両方)と、候補配列が少ない場合または見つからない場合のご希望を選択(設計方法を変えて追加設計、あるものだけご提示、対応についてご相談)
STEP2 設計結果を確認し、希望の合成サービスを指定してください。
ニッポンジーンからお客様へ提供する情報(設計結果)
配列情報
  • 熟練したスタッフが候補配列を1遺伝子に対して最適と思われる配列3~5箇所まで絞り込み、計5遺伝子まで検索します。
  • 検索結果(エクセルファイル)をお客様にE-mailにて報告します。
お客様からニッポンジーンへ提供する情報
合成サービス 合成サービスと希望保証収量と注文本数を指定してください。

  • siRNA 脱塩 1本(15 nmol / 45 nmol / 180 nmol)
  • siRNA 脱塩 15 nmol 3本セット
  • siRNA 脱塩 15 nmol 5本セット
  • スモールスケールsiRNA 脱塩 3 nmol 10本セット
  • siRNA PAGE 1本(15 nmol / 45 nmol)
  • siRNA HPLC 1本(6 nmol / 20 nmol / 80 nmol)
配列情報 候補配列からどの配列を合成するか選択
備考
  • アニーリングの有無をご指定ください。特に指定がない場合は、アニーリング済みの二本鎖状態で納品します。
  • アニーリング無しで納品の場合、チューブラベルには入力された「試料名」の後ろにセンス鎖は”-S”、アンチセンス鎖は”-AS”と記載します。
  • 「スモールスケールsiRNA 10本セット」を選択された場合、アニーリング無しの納品はご指定できません
STEP3 siRNAをお受け取りください。
仕様

siRNA無償設計サービス

構造 21 mer siRNA (二本鎖)の構造
合成鎖長 21 mer (19 mer RNA + 2 mer DNA)
形状 凍結乾燥・アニーリング済み(二本鎖状態)
設計について
設計方法
  • siRNA無償設計サービスでは、設計法のアルゴリズムに従い機械的に候補配列を出しています。
  • 設計はあくまでソフトウェア上での最適化であり、RNAi実験による確認は行いません。
  • 設計したsiRNA配列をBLAST検索し簡易的にスクリーニングを行っています。
注意事項
  • 設計サービスのみのご利用はできません。
  • 抑制保証はありません、オフターゲットならびにそれに起因する事象の回避保証はありません。
  • 配列のファックス・書面でのお申し込みはお受け致しかねますのでご注意ください。

効果的なsiRNA配列の設計法について、Ui-Teiらの研究グループや、Reynoldsらが提供した各siRNA配列設計法が世界的に広く知られています。
siRNA無償設計サービスでは、Reynolds法に改良を加えた弊社で長年の実績がある従来法(弊社標準法)と、Ui-Tei法(siDirect法)の2つから選択することが可能です。

弊社標準法 Reynolds法では配列19mer中
・GC含量が30%~55%(63%まで許容)
・配列中の特定のポジションに特定の塩基がある(コンセンサス配列)
・センス鎖・アンチセンス鎖の各5’末端の熱力学的安定性(ストランドバイアス)
以上の条件を満たすものが高いノックダウン効率を示すとされています。
これらの条件に弊社独自の基準(配列内のポジション、リーダー配列など)を加えたアルゴリズムを弊社標準法として、設計に使用しています。
Ui-Tei法 Ui-Tei法(siDirect法)では配列19mer中
・センス鎖5’末端がG/C
・アンチセンス鎖5’末端がA/U
・アンチセンス鎖5’末端より7塩基がAU richであること
・中心17mer中にGCストレッチがないこと
以上の条件を満たすものが高いノックダウン効率を示すとされています。
弊社では本基準を用いたアルゴリズムでも設計を実施できます。
両方 弊社標準法とUi-Tei法の条件を両方満たすものを選択することによって、ノックダウン効率が高いsiRNAが高確率で得られることが期待できます。両方の条件を満たす配列の設計も、本サービスで承っておりますが、条件を満たす配列がない場合は片方の条件を満たす配列をご提供いたします。
発 送

室温で発送します。
お手元に届き次第、-20℃にて凍結保存してください。

注文締め切り時間と納期

営業日の17:00までにE-mailまたはオーダーフォームよりご注文を受付した分が当日受注分となります。

  • 納期は受注日を0とした場合の発送日です。
  • 出荷は原則として月曜から金曜まで行っております。
  • 土・日・祝日および弊社指定の休業日は営業日にカウントされません。
  • 納期の異なるオリゴを同時にご注文された場合、納期の長い方に合わせてお送りします。
  • ご注文のなかに収量不足等で再合成になったものがある場合、再合成ができ次第まとめてお送りいたします。その場合は、E-mailご連絡いたします。

 

納期表(無償設計サービス)

注文内容 納期
スモールスケールsiRNA 10本セット 設計3営業日 + 合成10営業日
脱塩グレードsiRNA 1本 設計2営業日 + 合成5~8営業日
PAGEグレードsiRNA 1本 設計2営業日 + 合成10~12営業日
HPLCグレードsiRNA 1本 設計2営業日 + 合成9~13営業日
  • お客様による配列確認に要する時間によって、納期が変動する可能性がございます。
  • 希望保証収量によって合成にかかる時間は異なります。詳しくはこちらのページより価格表をご覧ください。
価 格

価格表(無償設計サービス)

注文内容 希望納入価格
スモールスケールsiRNA 10本セット 92,000円
siRNA 脱塩 15 nmol 1本 22,400円
siRNA 脱塩 15 nmol 3本セット 55,200円(18,400円/本)
siRNA 脱塩 15 nmol 5本セット 80,000円(16,000円/本)
siRNA 脱塩 45 nmol 1本 36,000円
siRNA 脱塩 180 nmol 1本 50,000円
siRNA PAGE 15 nmol 1本 36,000円
siRNA PAGE 45 nmol 1本 63,200円
siRNA HPLC 6 nmol 1本 32,000円
siRNA HPLC 20 nmol 1本 54,000円
siRNA HPLC 80 nmol 1本 73,600円

希望納入価格(税別)は設計料金、合成料金、精製料金を含みます。

注文方法
1. siRNA無償設計サービス申込用紙 をダウンロードします。
2. 申込用紙のお客様情報シートにお名前、お届け先住所、代理店名を入力します。
3. シート名「Order Sheet」に必要事項を入力して保存してください。
あらかじめ注意事項を必ずご一読いただき、ご理解いただいた上で、設計&合成サービスをご利用ください。
4. エクセルファイルをE-mail添付もしくはオンラインオーダーフォームよりお送りください。
納品場所

ご注文の際にご入力いただいたお客様の送り先住所へオリゴをお届けします。
お客様のご住所(請求先となります)と異なる住所、または代理店への配達をご希望の場合は、コメント欄もしくはメール本文に配達先住所と宛名と電話番号をご記入ください。

お支払い

本オリゴ合成サービスは、株式会社ニッポンジーンが富士フイルム和光純薬株式会社を国内販売元として提供するサービスです。ご注文の際には、富士フイルム和光純薬株式会社の代理店・特約店 をご指定ください。ご指定頂いた代理店・特約店より納品書、請求書を発行いたします。その他の納入業者を指定される場合には、弊社までお問い合わせください。


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