Double-Dye Probe(蛍光標識プローブ)

Double-Dye Probe(蛍光標識プローブ)

定量PCRによる発現量解析やジェノタイピングに最適なDouble-Dye Probeのカスタム合成を承っております。


仕 様

Double-Dye Probe合成

合成鎖長 合成スケール 精製 納品形態
15 – 35 merまで 0.2 μmol、1 μmol HPLC 乾燥品

修飾(5’ リポーター蛍光 – 3’ クエンチャ―)

5′ FAM – 3′ TAMRA
5′ FAM – 3′ Eclipse Dark Quencher
5′ FAM – 3′ MGB Eclipse
5′ FAM – 3′ BHQ1
5′ BriADD549 – 3′ Eclipse Dark Quencher
5′ BriADD549 – 3′ MGB Eclipse
5′ BriADD549 – 3′ BHQ1
5′ Yakima-Yellow – 3′ Eclipse Dark Quencher
5′ Yakima-Yellow – 3′ BHQ1
5′ Cyanine 3 – 3′ BHQ2
5′ Cyanine 5 – 3′ BHQ2
保証収量

5′ リポーター蛍光 – 3′ TAMRA
5′ リポーター蛍光 – 3′ Eclipse Dark Quencher
5′ リポーター蛍光 – 3′ MGB Eclipse
5′ リポーター蛍光 – 3′ BHQ1

合成スケール 保証収量
0.2 μmol 10 nmol
1 μmol 25 nmol

5′ リポーター蛍光 – 3′ BHQ2

合成スケール 保証収量
0.2 μmol 5 nmol
1 μmol 15 nmol
修 飾

FAM (520 nm)
リポーター蛍光としてよく選択されます。

BriADD549 (549 nm)
BriADD549は、蛍光色素VICと同一の蛍光スペクトル特性(最大励起波長:529 nm、最大蛍光波長: 549 nm)を示す蛍光色素です。マルチプレックスPCRのインターナルコントロールプローブの蛍光色素として使用できます。VIC用チャンネルを持つリアルタイムPCR装置との適合性が高いため、補正なしでそのまま使用することができます。

Yakima-Yellow (549 nm)
リアルタイムPCRによって1塩基多型(SNPs)の検出を行い遺伝子型の決定をする場合はホモ体とヘテロ体の判定のためにそれぞれ異なる蛍光を有する2本のプローブが必要です。この用途に対して一般にはFAMとVICの蛍光が用いられています。 Yakima-Yellowの最大蛍光波長(549 nm)、励起波長(530.5 nm)はVICの最大蛍光波長、励起波長ともに非常に近いためVIC用のチャンネルとフィルターのセッティングをそのまま利用することができます。

TAMRA
クエンチャ―蛍光として3’末端側にTAMRAを標識した場合、クエンチャーの効率より25merが最適の鎖長とされておりますが、最長35merまでのDouble-Dye Probeの合成を承ります。

Eclipse Dark Quencher
Eclipse Dark Quencherは蛍光ではなく熱としてエネルギーを放出するクエンチャーです。Eclipse Dark Quencherは蛍光を発しないため測定時のバックグラウンドが低くなり、より精度の高い実験が可能となります。

MGB Eclipse
MGB Eclipseプローブは、5’側に蛍光色素、3’側にEclipseクエンチャ―とマイナーグルーブバインダー(MGB)分子を有しています。プローブのMGB部位はDNAの二重らせん構造の副溝(minor groove)に結合して二重鎖構造を安定させるため、より高いTm値を有します。

注)商標について
本文中に記載されている製品名等は、各社の登録商標または商標です。本文中ではTM、(R)マーク等は明記していません。
※Yakima Yellow 、Eclipse Dark Quencher 、MGB-Eclipse は、ELITech Group. の商標です。
※VIC は、Applied Biosystems の商標です。
※BriADD は、ニッポンジーンマテリアル の商標です。

品質管理

全ての製品についてHPLC精製を行い、品質管理としてMALDI-TOF MS、分析用HPLCにて鎖長、蛍光色素のカップリングを確認いたします。製品には分析用HPLCチャートを添付します。

発 送

室温で発送します。
お手元に届き次第、-20℃にて凍結保存してください。

推奨される保存条件と安定性
乾燥状態、-20℃にて保存 ・・・・ 6か月
乾燥状態、室温にて保存 ・・・・ 1週間
液体状態、-20℃にて保存 ・・・・ 1か月(凍結融解の繰り返しは避ける)
液体状態、室温にて保存 ・・・・ 1日
乾燥状態、-20℃にて保存
6か月
乾燥状態、室温にて保存
1週間
液体状態、-20℃にて保存
1か月(凍結融解の繰り返しは避ける)
液体状態、室温にて保存
1日

注)液体状態で凍結保存する場合、凍結融解の繰り返しは避けてください。

注)蛍光色素は光によって劣化する恐れがありますので、遮光して保管してください。

注文締め切り時間と納期

営業日の17:00までにE-mailまたはオーダーフォームよりご注文を受付した分が当日受注分となります。

  • 納期は受注日を0とした場合の発送日です。
  • 出荷は原則として月曜から金曜まで行っております。
  • 土・日・祝日および弊社指定の休業日は営業日にカウントされません。
  • 納期の異なるオリゴを同時にご注文された場合、納期の長い方に合わせてお送りします。
  • ご注文のなかに収量不足等で再合成になったものがある場合、再合成ができ次第まとめてお送りいたします。その場合は、E-mailご連絡いたします。

 

納期表(Double-Dye Probe)

5′ FAM – 3′ クエンチャ―
5′ BriADD549 – 3′ クエンチャ―
5′ Yakima-Yellow – 3′ クエンチャ―

合成スケール 納期
0.2 μmol 5営業日
1 μmol 6営業日

5′ Cyanine 3 – 3′ BHQ2
5′ Cyanine 5 – 3′ BHQ2

合成スケール 納期
0.2 μmol 9営業日
1 μmol 10営業日
価 格

こちらのページより価格表をご覧ください。
希望納入価格(税別)は合成料金、精製料金を含みます。

注文方法
1. DNAオリゴ申込用紙 をダウンロードします。
2. 申込用紙のお客様情報シートにお名前、お届け先住所、代理店名を入力します。
3. シート名「Order Sheet」に必要事項を入力して保存してください。

精製:プルダウンで「HPLC」を選択
修飾:「5’修飾」列のプルダウンから「ダブルダイ」を選択
プルダウンリスト中の”EDark-Q”は、”Eclipse Dark Quencher”の略です。
「3’修飾」列は空欄のままにしてください。
合成スケール:プルダウンで「0.2」または「1」を選択
試料名:プライマーの名前を入力
ラベルに入力されるのは半角英数字15字以内です。
16文字目以降や全角文字はラベルに印刷されない可能性があります。
記号は 半角括弧、ハイフン、アンダーバー、ドットのみ可能です。
配列(5’ to 3’):半角英数字で入力(スペース不可)
鎖長(mer):配列の文字数が返されるため入力不要
Double-Dye Probeは15 – 35 merの鎖長に対応しています。
4. エクセルファイルをE-mail添付もしくはオンラインオーダーフォームよりお送りください。
納品場所

ご注文の際にご入力いただいたお客様の送り先住所へオリゴをお届けします。
お客様のご住所(請求先となります)と異なる住所、または代理店への配達をご希望の場合は、コメント欄もしくはメール本文に配達先住所と宛名と電話番号をご記入ください。

お支払い

本オリゴ合成サービスは、株式会社ニッポンジーンが富士フイルム和光純薬株式会社を国内販売元として提供するサービスです。ご注文の際には、富士フイルム和光純薬株式会社の代理店・特約店 をご指定ください。ご指定頂いた代理店・特約店より納品書、請求書を発行いたします。その他の納入業者を指定される場合には、弊社までお問い合わせください。


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